כיום, יושב הישוב אלון מורה על מורדותיו הדרומיים של רכס הר כביר, במרחק קילומטרים ספורים בלבד מהעיר שכם, וצופה אל תל בלטה - היא שכם המקראית. פסגת רכס הר כביר מתנשאת לגובה של 792 מ' מעל פני הים, והישוב ממוקם מגובה של 650 מ' ועד פסגה זו. בשל הגבהים הללו, נתברכנו מלבד הנוף המדהים, גם במזג אויר נוח הדומה לאווירה של ירושלים.
שטחו המתוכנן של הישוב, היושב על אדמות שבבעלות המדינה, מגיע לכדי 4,000 דונם, כשחלק ניכר משטח זה מיוער.
הנוף הנשקף מהישוב כולל: מצפון - למרגלות רכס הר כביר, עובר ואדי פרעה המושך מים בכל ימות השנה, ובו עובר הכביש הראשי המחבר את שכם לבקעת הירדן ומגיע עד לגשר אדם. זוהי "דרך מבוא השמש", בה עברו בני ישראל בכניסתם לארץ בהנהגתו של יהושע בן-נון, בדרכם לבנות מזבח על הר עיבל. מצפון לואדי נמצא רכס הר טמון, וממזרח - הבקעה והרי-גלעד.
ממערב לישוב - צופים עליו הר עיבל והר גריזים, שעליהם התקיים המעמד הנפלא של הברכה והקללה, וביניהם בתווך - יושבת העיר שכם ובה נמצא קברו של יוסף הצדיק.
מדרום - עמק סונר (עסנר) ובקעת בית-דגן (הכפר הערבי בית דג'ן), אשר בה מתוכננת לעבור דרך נוספת אשר תוביל לבקעה, ובהמשך - עמק המכמתת, אשר בו עוברת הדרך הראשית המחברת את שכם-רמאללה-ירושלים.
דרך העוקפת את שכם מדרום נפרצה בשנים האחרונות והיא מהווה חיבור בין יישובי גב ההר לכביש קדומים-כפר סבא. הדרך נקראת כביש גלעד ע"ש גלעד זר הי"ד, קב"ט מוא"ז שומרון שנרצח בסיון תשס"א.
